Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms