Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGIP1Q9BQI5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGIP1Q9BQI5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms