Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms