Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOPXQ9BPY8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOPXQ9BPY8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms