Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUSP9Q99956 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP9Q99956 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms