Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRCQ99895 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms