Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms