Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHOX2BQ99453 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms