Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRRC1Q96M27 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms