Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEIL2Q969S2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms