Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRG4Q92954 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms