Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBXN4Q92575 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms