Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TOPBP1Q92547 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms