Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms