Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF548Q8NEK5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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