Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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C9orf40Q8IXQ3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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C9orf40Q8IXQ3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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C9orf40Q8IXQ3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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