Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD163Q86VB7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD163Q86VB7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms