Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATG4DQ86TL0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms