Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms