Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms