Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms