Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TSSK4Q6SA08 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSSK4Q6SA08 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms