Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms