Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NANOGP8Q6NSW7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms