Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYW3Q6IPR3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms