Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRN2

C6orf10, Uncharacterized protein C6orf10, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf10Q5SRN2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C6orf10Q5SRN2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms