Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC27A3Q5K4L6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms