Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCID2Q5JVF3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms