Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDK2Q58EX2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDK2Q58EX2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms