Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB6CQ53S08 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms