Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C17orf58Q2M2W7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms