Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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COL24A1Q17RW2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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COL24A1Q17RW2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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COL24A1Q17RW2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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COL24A1Q17RW2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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COL24A1Q17RW2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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COL24A1Q17RW2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COL24A1Q17RW2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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