Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IMPG1Q17R60 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms