Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PDK4Q16654 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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