Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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