Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CRY1Q16526 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRY1Q16526 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CRY1Q16526 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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