Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GABRA6Q16445 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GABRA6Q16445 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms