Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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SCN9AQ15858 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCN9AQ15858 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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