Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VAMP3Q15836 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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