Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMD6Q15008 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD6Q15008 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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