Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBFBQ13951 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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