Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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C1orf61Q13536 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf61Q13536 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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