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| FOXE3 | Q13461 | DUSP8-202 | ENST00000397374 | 4480 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.11 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZDHHC9-202 | ENST00000371064 | 2473 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.11 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HSPA8-224 | ENST00000534624 | 2463 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.11 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LSM12-204 | ENST00000591247 | 2484 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.11 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | B3GNT3-201 | ENST00000318683 | 2226 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.11 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | STK17A-201 | ENST00000319357 | 3368 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.11 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PTK7-202 | ENST00000230419 | 4272 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TSC2-204 | ENST00000401874 | 5421 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FAM104A-202 | ENST00000405159 | 2865 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | CACNA1H-206 | ENST00000565831 | 7815 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | ATXN2-219 | ENST00000550104 | 4648 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | EHD2-202 | ENST00000538399 | 1766 nt | TSL 2 BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MYLK2-202 | ENST00000375994 | 2956 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC023824.1-201 | ENST00000562945 | 2975 nt | BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GMPPA-202 | ENST00000341142 | 1524 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC092053.1-201 | ENST00000605787 | 1936 nt | BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | DHX30-205 | ENST00000445061 | 4065 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC055717.3-201 | ENST00000622967 | 595 nt | BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC092902.6-201 | ENST00000641783 | 218 nt | BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PSMD2-201 | ENST00000310118 | 3449 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.1 | □□□□□ -0.31 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | RNU1-129P-201 | ENST00000384064 | 167 nt | BASIC | 13.09 | □□□□□ -0.31 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | PML-206 | ENST00000395135 | 2199 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.09 | □□□□□ -0.31 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | LINC01485-205 | ENST00000523617 | 586 nt | TSL 2 BASIC | 13.09 | □□□□□ -0.31 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LHX5-AS1-201 | ENST00000551357 | 522 nt | TSL 2 BASIC | 13.09 | □□□□□ -0.31 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | U1.21-201 | ENST00000580816 | 167 nt | BASIC | 13.09 | □□□□□ -0.31 | | |