Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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