Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRN3Q13033 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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