Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSTF3Q12996 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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