Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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