Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ANK3Q12955 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms