Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2AQ12879 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
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