Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCB1Q12824 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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